6月2日，深圳华大基因研究院和德国汉堡-埃普多夫大学医学中心牵头宣告，对病菌仅有基因组序列的分析表明，造成近期德国肠道病病毒感染疫情的病菌是一种兼备肆虐、产毒和肠发炎等特征的新致病性大肠杆菌。农民正在遭到成百上千万欧元的损失，并未被食用的蔬菜和水果堆积成山，798人的生命岌岌可危如果再行不追查元凶的话，这场现代史上规模仅次于的大肠杆菌涉及类疫情，难以想象还不会引起什么样的后果。从5月中旬开始，一种少见的大肠杆菌变种从德国蔓延到至整个欧洲。
这个最初被确认为肠出血性大肠杆菌（EHEC）的刺客，造成患者经常出现腹痛、呕吐、感冒和腹泻等症状，严重者不会发展沦为发炎尿毒综合征，严重威胁生命。由于最初误以为疫情源头是黄瓜、西红柿等蔬菜水果，爱好沙拉的欧洲人面临生菜时被迫犹豫不决了，这造成无辜的菜农损失惨重；另一方面，疫情引发了国际关系的极为紧绷，本月初，俄罗斯宣告禁令从所有欧盟国家进口新鲜蔬菜，引发了欧盟强烈抗议。不顾一切人们对无名刺客一筹莫展时，中国科学家却在短短三天的时间内，勾勒出有它的面目及作案特征，并获取较慢判断罪犯的方法。6月2日，深圳华大基因研究院和德国汉堡-埃普多夫大学医学中心牵头宣告，对病菌仅有基因组序列的分析表明，造成近期德国肠道病病毒感染疫情的病菌是一种兼备肆虐、产毒和肠发炎等特征的新致病性大肠杆菌。
这次和中国的合作很无意间，毕竟我们的转机我们的运气到了。德国汉堡-埃彭多夫大学医学院医学博士、参予此次德国大肠杆菌疫情研究小组的研究成员莫里茨亨奇克在拒绝接受中国青年报专访时说。
德国方面用全情投放、出现异常高效、能力超群、速度难以置信来形容中国合作伙伴从5月15日攻击一位来自德国北部城市迪普霍尔茨的83岁老太太开始，刺客以令人难以想象的速度侵袭。根据世界卫生组织（WHO）最近获取的信息，疫情蔓延到至还包括法国、英国、西班牙等欧洲11个国家，甚至还漂洋过海到了美国。
德国负责管理监控全国疫情的罗伯特科赫研究所6月17日发布的疫情通报表明，这个面目模糊不清的刺客在一个多月的时间里夺回了38人的生命，导致3408人病毒感染，其中798人发展为溶血性尿毒综合征，生命岌岌可危。大肠杆菌是人类肠道菌群的长时间组成部分，在一般来说情况下对人类没危害。但某些变种如肠出血性大肠杆菌，就不会造成相当严重的疾病。在世界各地，每年都会有肠出血性大肠杆菌病例的经常出现，有时候也不会经常出现溶血性尿毒综合征甚至神经，造成患者经常出现语言表达障碍、难免会、相当严重癫痫甚至昏倒的症状。
除此之外，患者主要是20岁以上的成年人，尤其是女性，而不是以往病例中少见的儿童。不顾一切罗德为突如其来的疫情忙得焦头烂额时，他在餐厅里遇上了刚公干回来的中国博士后研究生杨亮。这个正在联系基因组测序事宜的中国学生，给导师出有了个主意：联系中国华大基因研究院做到基因组测序，这家研究机构不仅是全球仅次于的基因排序和研究中心，而且刚上马了近期的测序平台。
之前我们听闻过华大基因，告诉它是一个在基因组测序方面有很强的研究能力和非常丰富研究经验的机构，但是直到杨亮建议前，我们都还没确实考虑过合作。亨奇克说道。一场跨国合作早已积极开展。5月30日，德国方面挑选的最不具典型性的样本租车到了深圳。
收到样本后我们立刻开始著手测序以及数据分析。中国深圳华大基因研究院发言人杨碧澄向中国青年报讲解说道。
约十几位、平均年龄25岁的华大基因研究人员参予了此次研究。每个人都把这件事情作为第一优先级，经常不会休息时间研究到第二天早上，连端午节都没休假。参予其中的研究人员李俊桦说道，这件事情很最重要，一刻也无法推迟。这种较慢的反应机制，让西班牙一家负责管理对该刺客基因组序列展开自动分析的生物信息公司工作的研究员玛丽娜曼瑞奎赞叹不已。
她在拒绝接受中国青年报专访时评价说道：华大的优点之一在于，即便是周末联系他们，也能很快获得恢复。这种随时待命的高效恢复对于疫情涉及工作至关重要。
德国方面对这次的合作也是赞赏深得。亨奇克用了四个词来形容这个中国合作伙伴全情投放、出现异常高效、能力超群、速度难以置信。
一切出乎意料我的意料，对我来说，这是一个惊艳。罗德说道。粽子版基因组图谱完全揭露刺客的老底在已完成基因组测序和数据分析后，华大基因研究院改版了一份基因组序列图谱，这意味著调至了刺客的档案，完全揭露了对方的老底。
这份实施于端午节的图谱，又被戏称为粽子版基因组图谱。华大基因研究院还研制出了诊断试剂盒。用于这种方法，可以将必须两三天的检测过程延长为两三个小时，这可以给全球范围内的病情临床、疫情监测和污染源调查获取反对。
粽子版基因组图谱展出了刺客的全部案底：这种病菌是两类病原基因融合在一起的综合体，即来自肠出血性大肠杆菌和肠黏附性大肠杆菌（EAEC）的病原基因。作为刺客的第一个凶器，肠出血性大肠杆菌反击血液中的红细胞，导致红细胞沉淀、微血管堵塞等，不会造成急性肾衰竭。另众多凶器肠黏附性大肠杆菌则不利于病菌在肠细胞上吸附，从而使其能在肠道内宿居于更加长时间，缩短了反击红细胞的时间，导致更大的毁坏。这二者的融合有可能造成了这个病菌有如此强劲的攻击性。
亨奇克说道。鉴于此，德国哥廷根大学的研究人员建议将刺客改名为肠挤满黏附性大肠杆菌。更加可怕的是，它还具备勇猛的防御能力。它所含对还包括头孢菌素、青霉素和链霉素类抗生素的耐药基因，不会造成部分抗生素化疗违宪。
它既有矛又有盾，一方面可以用于毒力基因去获释毒力，另外一方面它对药物还有抗生素不会有防御性，能对自己展开一些维护。杨碧澄说明说道。不过，对于病原基因的病原机理，比如它是怎么样把毒素释放出，以及怎么样去掌控它，还必须更好的实验和研究。
这也许要从刺客的祖先株上找寻突破。根据粽子版基因组图谱的分析，2001年的欧洲分离出来株很有可能是这个刺客病菌的直系祖先。如今这位刺客之所以享有如此强劲的能力，或许是因为经过10年的演化，取得了一些新的基因，从而具备了耐更加多种抗生素的能力。
基因组测序和数据分析协助我们更进一步界定，哪些基因是导致肠出血性大肠杆菌的适当基因，也有助理解病菌的演进情况，还为我们研制疫苗获取了协助。这些研究将不会有助我们最后得出结论有针对性的化疗方案。
亨奇克说道。全世界科研工作者第一次一起研究同一个病菌这并不是中国科学家第一次在世界范围内的疫情研究中发挥作用。在2003年愈演愈烈的相当严重急性呼吸道综合征（SARS）疫情中，华大基因研究院也参予了基因组测序，并迅速研制出诊断试剂盒。但SARS在三四个月以后才研究出有有效地抗体，这一次年长的中国科研人员们争分夺秒，期望抢走在刺客之前攻占领地。
疫情愈演愈烈的时候，时间是最重要的。杨碧澄说道。当中国科研工作者寻找刺客病菌的基因组图谱后，想起的第一件事情就是立刻发布到网上。
这正是对付刺客的另一个法宝合作。当中国科学家得出结论基因组序列后，立刻用于Facebook、Twitter、博客等交流手段和全世界的科研工作者一起探究刺客的起源与应付。
亨奇克指出这次的基因组测序研究是一次名副其实的国际合作，德国获取样本，中国以难以置信的速度已完成了测序，获得基因组序列后，中国、德国、法国等国的研究人员对数据展开理解和分析。《科学》杂志也在近期一期发表文章，讲解全球科学家联合研究病原大肠杆菌病菌基因组序列的过程，其中尤其提及了中国科学家的高效工作。这应当是全世界科研工作者第一次一起研究同一个病菌。
杨碧澄说道。我们最喜爱华大的一点在于，他们第一时间发布了基因组序列原始数据，此前没任何一个机构这么做到过。和所有人分享这份价值根本性的信息，中国是第一个。
到目前为止，也只有华大基因对外发布了所有原始数据。曼瑞奎说道。近期德国疫情有数显著减慢迹象，患病人数大幅度增加。
根据中国卫生部近期公布的公告，虽然中国对外交流人员往来频密，不存在输出性疫情再次发生的风险，但是累计目前，中国境内仍未有病例报告。但是，情况仍然不容乐观。根据6月20日的信息发布，肠出血性大肠杆菌有可能已通过感染者的排泄物转入河流等周边环境，调查人员在德国黑森州一条小溪中检验出有了致病菌株，而且已被证实不存在人际传播的情况，这可能会带给更大的危机。
对于缉捕刺客病菌的身体健康警察们来说，也许非典的先例可以获取救赎。现在的情况和SARS疫情有不少相似之处，比如无法几乎确认传染源、继续没疫苗和化疗方法。
亨奇克说道，以后今日仍然没有效地化疗SARS的方法，但是疫情却早就依赖消毒、隔绝等手段以求遏止。或许德国大肠杆菌疫情也可以通过国家和公共卫生官员及时的协商和介入，在没化疗方案的情况下制止疫情的蔓延。
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